Gdy marzyciel Arlo - pół chłopiec, pół aligator - dowiaduje się, że pochodzi z Nowego Jorku, postanawia opuścić swój bezpieczny dom na bagnach i udać się na poszukiwania dawno zaginionego ojca. Serial "Arlo w Nowym Jorku" rozpoczyna się w momencie, gdy Arlo i jego nowi przyjaciele zakładają sklep w podupadającej dzielnicy Nowego Jorku, tym samym nadając jej drugie życie.