Kimi ga Nozomu Eien opowiada historię życia pewnej grupki młodych osób. Haruka która jest uczennicą 3 klasy szkoły średniej zakochuje się w Takayukim który odwzajemnia jej uczucie. Pewnego dnia umawiają się ze sobą, jednak po drodze na miejsce spotkania Takayuki spotyka najlepszą przyjaciółkę Haruki - Mitsuki. Mitsuki, która tego dnia ma urodziny, prosi Takayukiego o prezent. Ten po zakupieniu jej pierścionka biegnie na umówiene miejsce, na którym miał się spotkać z Haruką. Jednak na miejscu dowiaduje, się że w tym czasie gdy on kupował prezent urodzinowy swojej koleżance, jego dziewczyna wpadła pod samochód. Haruki odzyskuje przytomność dopiero po 3 latach.....

Haruka Suzumiya wraz z przybyciem do nowej szkoły zakochuje się w uczniu o imieniu Takayuki. Takayuki także zakochuje się w Haruce, i wszystko byłoby wspaniale, gdyby nie wypadek Haruki. Dziewczyna trafia w śpiączce do szpitala, gdzie leży przez 3 lata. Przez ten czas Takayuki związał się ze swoją przyjaciółką z dzieciństwa - Mitsuki. Gdy Haruka budzi się, myśli, że on dalej jest jej chłopaiem i że minęły zaledwie 2 tygodnie. Prawda jednak wychodzi na jaw...

Haruka zdradza swej przyjacółce Mitsuki, że skrycie kocha się w koledze z klasy - Takayukim, po czym prosi ją aby zaprzyjaźniła się z nim i pomogła jej w wyznaniu mu miłości. Gdy cała sytuacja ma się już pozytywnie rozwiązać (Haruka ma iść na randkę z Takayukim) Haruka wpada pod samochód i zapada w śpiączkę na kolejne 3 lata...