Po pokonaniu Bowsera i uratowaniu Brooklynu Mario staje przed nowym zagrożeniem: złowrogim sojuszem Wario i Bowsera Jr. Teraz, wraz z przyjaciółmi i Yoshim u boku, musi powstrzymać ich plany podboju świata.
Film inspirowany objawieniami św. Małgorzaty Marii Alacoque opowiada o kulcie Najświętszego Serca Jezusa i sile Bożej miłości. Poprzez współczesne świadectwa pokazuje, jak wiara pomaga odnaleźć sens w świecie pełnym samotności i zagubienia.
Film opowiada o duchowej więzi Karola Wojtyły z Matką Bożą, która miała prowadzić Jana Pawła II przez cały pontyfikat, oraz o znaczeniu objawień maryjnych.