"Bajkalski szlak" jest poświęcony tysiącom Polaków zesłanych po klęsce narodowych powstań, którym przyszło żyć nad Bajkałem. Wśród zesłańców nie brakowało wybitnych naukowców i badaczy. Wielu z nich całkowicie wrosło w tę ziemię i poświęciło się pracy na tych ziemiach. Benedykt Dybowski, Jan Czerski, Aleksander Czekanowski, Wiktor Godlewski, św. Rafał Kalinowski - to o nich miejscowi mówią dzisiaj z najwyższym uznaniem. Wybitnych Polaków wspomina wnuczka Benedykta Dybowskiego, Władysława Dybowska. Mówią o nich również ci, dla których ich prace są podstawą obecnych badań. Podróżując koleją transsyberyjską, poznajemy miejsca, gdzie Polacy żyli i pracowali, między innymi Irkuck, Bajkalsk, Listwiankę, Usole Sybirskie. Polacy mają też swój niebagatelny wkład w budowie kolei transsyberyjskiej. Ważnym elementem filmu są losy potomków polskich zesłańców podróżujących pociągiem. Towarzyszy im ekipa Telewizji Polskiej.