Balto jest ojcem kilku szczeniąt, z których wszystkie, poza jednym Szarką, są po mamie psami rasy husky. Jedynie Szarka wrodziła się w ojca nie jest podobna do reszty rodzeństwa. Gdy nadchodzi czas rozstania z rodzicielskim domem, dzieci Balta i Jenny znajdują miejsca u ludzi. Zostaje tylko Szarka, której nikt nie chciał. Nie rozumie, dlaczego spotkał ją taki los. Balto wyjaśnia jej tajemnicę swojego pochodzenia. Szarka ma żal do rodziców, że wcześniej nie powiedzieli jej prawdy. Ucieka i postanawia odnaleźć swoje miejsce w świecie. Zaniepokojony Balto, nawiedzany przez dziwne sny, w których występuje tajemniczy biały wilk i kruk wyrusza, by przyłączyć się do Szarki. I tak rozpoczyna się niezwykła przygoda pośród lodowatych, niegościnnych bezkresów Alaski.