Podobno we wszystko zamieszna była jakaś siatka pedofilska, z którą rodzice JonBenet mieli większe bądź mniejsze powiązania. Mówi się też, że dziewczyna była ofiarą kontroli umysłu. Inni uważają, że mógł być to ktoś z rodziny - rodzice lub brat (podobno wykazano ponadprzeciętną inteligencję u brata dziewczynki oraz u jej matki). Świry nieraz bywają bardzo inteligentni ;)