Bastian (Jonathan Brandis) po raz drugi trafia do antykwariatu Koreandera (Thomas Hill). Stary znajomy wręcza mu magiczną księgę, w której opisane jest wszystko, czego nie można wyrazić. Jej stronice pozostają białe, a treść zmienia się wraz z każdą kolejną lekturą. Dzięki amuletowi, znajdującemu się na okładce, chłopiec ponownie przenosi się do krainy Fantazja. Czeka go trudne zadanie, musi wspomóc mieszkańców Srebrnego Miasta w walce ze złą czarodziejką. Tym razem wspólnie z Atreyu (Kenny Morrison) przyjdzie im zmierzyć się ze złowrogą Xaideą (Clarissa Burt) oraz jeszcze raz stanąć przed obliczem Cesarzowej (Alexandra Johnes). Xaidea sprawia, że ilekroć Bastian używa amuletu spełniającego życzenia, traci cząstkę pamięci.