W spektakularnym finale epickiej sagi o „Więźniu labiryntu” Thomas staje na czele grupy zbiegłych Streferów, którzy wyruszają z ostateczną misją. Jeśli chcą ocalić swych przyjaciół, muszą wkraść się do legendarnego Ostatniego Miasta – kontrolowanego przez DRESZCZ labiryntu, który kryje w sobie najniebezpieczniejszą z dotychczasowych pułapek. Ci, którzy wyjdą z niej żywi, poznają odpowiedzi na pytania, które Streferzy zadają sobie od chwili, gdy znaleźli się w pierwszym labiryncie.
W ostatniej scenie widzimy Thomasa na plaży, spogląda na fiolkę z antidotum, ale też na statek. Pierwsze co przychodzi do głowy, to pomyślał żeby zawieźć lek w inne części świata. Z tym jednak będzie problem, ponieważ:
1. Nie ma tego leku zbyt wiele,
2. Wszystkie osoby które potrafiły stworzyć serum z krwi Thomasa...