Ma troje młodszego rodzeństwa: brata Páidiego Murphy'ego oraz dwie siostry - Sile Murphy i Orlę Murphy.

Zjawił się na przesłuchaniu do roli Batmana w filmie "Batman - Początek", którą dostał Christian Bale. Jednakże Cillian spodobał się tak bardzo, że pozwolono wcielić mu się w postać Stracha na Wróble - przeciwnika człowieka-nietoperza.

Cillian grał na gitarze w kilku zespołach wraz ze swoim bratem Páidi, z których jeden, najbardziej udany, nazwali Sons of Mr. Greengenes, na cześć piosenki ich idola, Franka Zappy. Byli oni także obsesyjnymi fanami zespołu The Beatles.

Ukończył Presentation Brothers College w Cork (Irlandia).

Był pierwszym wyborem reżysera do roli Arona Ralstona w filmie "127 godzin". Angaż otrzymał James Franco.

Był brany pod uwagę do roli w filmie "Once", jednak musiał odrzucić propozycję ze względu na pracę przy innym projekcie. Angaż otrzymał Glen Hansard.

W 2013 roku wyreżyserował teledysk do piosenki "Hold Me Forever" zespołu Money.

Odrzucił rolę Joego w filmie "Podkręć jak Beckham". Angaż otrzymał Jonathan Rhys Meyers.

Wystąpił w następujących teledyskach:
- 2011 r. - "I Break Horses" - Winter Beats;
- 2015 r. - "The Clock" - 8:58;
- 2017 r. - "The Meetings Of The Waters" - Fionn Regan.

W 2014 roku podłożył głos w reklamie piwa Guinness.

Miał zagrać rolę Mo Lundy'ego w filmie "The Free World", jednak musiał zrezygnować z udziału w produkcji. Zastąpił go Boyd Holbrook.

Był brany pod uwagę do użyczenia głosu Cody'emu Maverickowi w filmie "Na fali". Angaż otrzymał Shia LaBeouf.

Był brany pod uwagę do roli Paxtona w filmie "Skazani na siebie". Angaż otrzymał Chiwetel Ejiofor.

Był brany pod uwagę do ról rzeczoznawcy ds. przedmiotów kolekcjonerskich, pasażera i Josepha w filmie "Rodzaje życzliwości". Angaż otrzymał Joe Alwyn.