Był zaręczony z Jessicą Albą, spotykali się przez ponad 3 i pół roku. Kilka miesięcy temu zerwali zaręczyny, teraz podobno znowu się spotykają, jednak oboje mówią iż obecnie łączy ich jedynie przyjaźń.

Od pewnego czasu przyjaźni się z Davidem Boreanazem (aktorem znanym ze serialu "Anioł Ciemności").

Michael Weatherly w 1994 roku przez Amerykańską gazetę poświęconą serialom telewizyjnym, został określony jako aktor z wielkim talentem który nie potrafi zrobić kariery kinowej...
Weatherly miał wtedy niespełna 26 lat, cieszył się dużą popularnością wśród nastolatek, jednak jego kariera nie rozwijała się zbyt dobrze, znany był jedynie z dwóch seriali "Loving" i "The City".