Chciałem odpowiedzieć na pytanie.... ale ostatecznie uznałem ze chyba faktycznie też nie wiem dlaczego to zrobił.
Może Walter chciał zrobić doszczętną czystkę w swoim otoczeniu nie zważając na to jakie mógłby mieć ku temu powody? :P
Taki znak dla widza ,,Walter stał się potworem, nic go nie usprawiedliwia''

Bo była złą kobietą, psychopatką i jeśliby jej nie zabił, wzięłaby się za rodzinę Walta.

Nic dodać, nic ująć. Martwił się o to, czy nikt nie będzie mógł grozić jego rodzinie po śmierci.

Zabij ją ponieważ:
-zagrażała jego rodzinie,
-nasłała na rodzine Wolta nazistów (choć w momencie zbrodni o tym nie wiedział jeszcze)
-gdyż Lidia wydała zlecenie na Majka i innych (wiedział że likwiduje świadków)
-gdyż miał zrobić to już wcześniej (rycyna pod kapeluszem)
-gdyż chciała go zabić! - a on to przewidział (ostatni telefon w finale).