Alexis Arquette jest córką aktora i producenta filmowego Lewisa Arquette  i Brendy Denaut, poetki, aktorki teatralnej i politycznej aktywistki. Jej dwie starsze siostry Rosanna i Patricia oraz dwaj starsi bracia Richmond i David są również aktorami. W młodości odbyła podróż po Europie występując i tancząc przed publicznością. Mając 20 lat zadebiutowała na dużym ekranie rolą transseksualnej prostytutki  Georgette w "Przeklęty Brooklyn" Uli Edel'a. Rola 30-letniego malarza Andrew Magnusa w filmie "Never Met Picasso" Stephena Kijaka przyniosła jej nagrodę na Festiwalu Filmowym Gejów i Lesbijek w Los Angeles. Wystąpiła też w filmach: "Myszy i ludzie", "Ich troje", "Pulp Fiction", "Dzieci kukurydzy 5", "Od wesela do wesela", "Spun". W 2006 roku poddała się operacji zmiany płci. Aktorka zmarła w roku 2016 w otoczeniu rodziny.