W latach 1988-2003 była w związku z profesorem angielskiego Dannym Mozesem. Ma z nim dwójkę dzieci – Samanthę i Charlesa Ezekiela.

We wrześniu 2004 roku podano do informacji, że prawie od roku była w związku z Christine Marinoni. W 2006 roku przyznała się do tego związku. W maju 2012 roku wzięła ślub z Christine Marinoni w urzędzie miasta Nowy Jork. W 2011 roku Marinoni urodziła syna - Maxa Ellingtona. Aktorka deklaruje się jako osoba biseksualna.

Zwalczyła raka piersi, ale przez to przez dwa lata nie mogła występować. Obecnie promuje działania przeciw rakowi piersi, pełniąc rolę ambasadora organizacji Susan G. Komen for the Cure.

Źrodło:
pl.m.wikipedia.org/wiki/Cynthia_Nixon