Wyobraź sobie broń nuklearną wielkości pięści, o sile zdolnej unicestwić miliony... Teraz wyobraź sobie, co by się stało, gdyby wpadła w niepowołane ręce.... Właśnie to się stało.

Akcja gry "Shadow Ops: Red Mercury" - realistycznego shootera FPS, osadzona jest w niedalekiej przyszłości. Gracz dołącza do elitarnej jednostki Delta Force. Korzystając z najnowszego enginu Unreal'a, zostanie przeniesiony przez grę do miast i miasteczek Środkowego Wschodu, wojskowych baz w głębi Rosji i innych miejsc na świecie, takich jak Filipiny, Bośnia czy kraje Wschodniej Europy.

Rosyjska podwójna agentka zdobywa informacje o projekcie "Red Mercury" - tajemniczej substancji, służącej do akceleracji reakcji nuklearnej. Amerykańska agencja bezpieczeństwa (NSA) zleca graczowi odszukanie owej substancji zanim zostanie użyta do zbudowania małych bomb nuklearnych na potrzeby organizacji terrorystycznych. Rosjanie też ruszają w pogoń za "Red Mercury" - twierdzą, że również aby zdążyć przed terrorystami. Czy mówią prawdę..?