Imperium Klingonów doznaje poważnego ciosu podczas eksplozji kopalni na jednym ze swoich księżyców. W rezultacie klingońskie władze chcą podpisania pokoju z Federacją. Kapitan Kirk (William Shatner) ma wyruszyć w swą ostatnią misję i przyjąć ambasadora Gorkona (David Warner). Niestety, wkrótce po przyjęciu na Enterprise, ambasador zostaje zamordowany, a proces pokojowy załamuje się. Klingoni za morderstwo chcą ukarać Kirka, w rezultacie czego Kirk i dr McCoy (DeForest Kelley) zostają skazani na ciężkie więzienie. Tylko Spock (Leonard Nimoy) może ich uratować.