Tobey karierę aktorską rozpoczął od krótkich epizodów w serialach. Wystąpił m.in. w "
Roseanne" i "
Cudownych latach". Dostał rolę główną w sitcomie "
Great Scott!", ale serial zdjęto po dziewięciu tygodniach. W 1992 roku trafił na plan filmu "
Empire Records", gdzie miał grać małą rolę, jednak w trakcie realizacji filmu zrezygnował, gdyż chciał na pewien czas odpocząć od aktorstwa, ze względu na problemy osobiste. Wrócił do pracy na planie krótkiego filmu "
Duke of Groove", który otrzymał nominację do Oskara, co pomogło mu w dalszej karierze. Wystąpił w filmie "
Przejażdżka", a w 1997 roku jako sprzedawca butów pojawił się na planie filmu "
Przejrzeć Harry'ego" w reżyserii
Woody'ego Allena. Na planie "
Burza lodowa" zetknął się pierwszy raz z reżyserem
Angiem Lee.
Swoją pierwszą znaczącą rolę odegrał w 1998 roku w "
Miasteczku Pleasantville". W tym samym roku zagrał w krótkim, kontrowersyjnym filmie "
Don's Plum", który został zakazany w USA. W 1999 roku zagrał w kolejnym filmie
Anga Lee "
Przejażdżka z diabłem" oraz we "
Wbrew regułom" na podstawie noweli
Johna Irvinga. Ten obraz otrzymał 2 Oskary i 7 nominacji. W 2000 roku wystąpił w filmie "
Cudowni chłopcy" z
Michaelem Douglasem. W styczniu 2001 rozpoczęły się zdjęcia do "
Spider-mana", w którym Tobey zagrał rolę tytułową.